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瑞士研究人員設(shè)計出小巧高效的“基因剪刀”

新華社北京9月25日電 瑞士蘇黎世大學日前發(fā)布公報說,該校研究人員領(lǐng)銜的團隊成功改造一種源自細菌的小型蛋白質(zhì)TnpB,并利用它設(shè)計出小巧而高效的“基因剪刀”,可望使基因編輯變得更容易。相關(guān)論文日前已發(fā)表在英國《自然·方法學》雜志上。

據(jù)介紹,基于CRISPR-Cas系統(tǒng)的新型基因編輯技術(shù)被稱為“基因剪刀”,已被廣泛應用于基因工程領(lǐng)域。CRISPR-Cas系統(tǒng)源自細菌防御病毒入侵的機制,其中用到的Cas蛋白質(zhì)是由更小的分子演變而來,TnpB就是該技術(shù)常用蛋白質(zhì)之一Cas12的“祖先”。

Cas蛋白質(zhì)分子通常較大,要將它們運送到細胞內(nèi)需要進行基因編輯的位置并不容易。科學界已嘗試將CRISPR-Cas系統(tǒng)中的Cas蛋白質(zhì)分子替換成TnpB等前體分子,從而設(shè)計出更小巧的“基因剪刀”,但發(fā)現(xiàn)其編輯效率不高。最新研究中,蘇黎世大學等機構(gòu)研究人員通過對TnpB分子進行改造,使其基因編輯效率提高了約4.4倍。在動物實驗中,患高膽固醇血癥的小鼠在經(jīng)過用TnpB分子制成的“基因剪刀”治療后,膽固醇水平顯著降低。

新研究采用的TnpB分子提取自抗輻射奇異球菌,這是一種能耐受大劑量輻射和多種嚴苛環(huán)境的細菌。科研團隊利用自主研發(fā)的人工智能模型,預測了TnpB分子對小鼠細胞基因組中1萬多個靶向位點的編輯效果。

借助人工智能模型的預測,研究人員用常見的腺病毒載體運載TnpB分子,在動物實驗中實現(xiàn)高效的基因編輯,其中在小鼠肝臟和腦組織中的編輯效率分別達到75.3%和65.9%。由于TnpB分子僅由約400個氨基酸組成,基于該分子的“基因剪刀”只需單個病毒顆粒就能運載。作為對比,Cas9和Cas12蛋白質(zhì)分子尺寸超過1000個氨基酸,需要使用更高的載體劑量。

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